El Programa Académico de Tecnología en Desarrollo de Software (TEDESOFT) de la Universidad del Valle tiene sus raíces en la creación del Departamento de Ciencias de la Información y los Sistemas adscrito a la Facultad de Ingeniería, del Programa de Magíster en Ingeniería Industrial y de Sistemas, del Centro de Cálculo Electrónico y en el Programa Académico de Tecnología en Sistemas de Información en la modalidad a distancia (creado en el año de 1985).
En ese entonces, la concepción sobre la Ingeniería de Sistemas se centraba en los sistemas de procesamiento de datos y la investigación de operaciones. La idea se basaba en complementar la formación de ingenieros de diversas áreas con los conceptos, técnicas y herramientas de la Ingeniería de Sistemas. Este modelo suplió, en gran medida, la demanda de profesionales con formación en sistemas.
Inicialmente, se da el surgimiento de programas con énfasis en Sistemas, entre ellos, el de Tecnología en Sistemas de Información modalidad a Distancia, creado en 1984, a través de la Resolución 034 de abril de 1985 del Consejo Superior, mediante la cual se ratifica y define el currículo del Plan de Estudios de esta. Así, se sustentó la formación en sistemas con énfasis en los desarrollos propios del procesamiento de datos.
En el Plan de Desarrollo Univalle 1986 - 2000, se incluye un capítulo sobre la Informática en la Universidad del Valle, en el cual se reconoce la necesidad de crear una unidad académica y Programas de formación en el área específica de la Ingeniería de Sistemas. La nueva unidad, denominada Departamento de Ciencias de la Computación se creó, finalmente, en 1992.Para el año 1991 se crea la Comisión de Diseño del Programa de Ingeniería de Sistemas, con docentes de la Sección de Informática del Departamento de Información y Sistemas, con el fin de estructurar el documento base para la creación del nuevo programa. En el documento se justifica el nuevo programa en términos del compromiso adquirido por la Universidad del Valle de ofrecer un segundo ciclo para los estudiantes del Programa Académico de Tecnología en Sistemas de Información (PATSI), cuyos primeros egresados se esperaban a partir del segundo semestre de 1991.
Después la Universidad estimó, como una de sus metas básicas, la ampliación de la cobertura de sus programas de formación con el ofrecimiento de alternativas en campos tan importantes como la Informática y la Electrónica. Por Resolución No. 009 del 1 febrero de 2000, el Consejo de Facultad de la Facultad de Ingeniería aprobó una nueva Estructura Académico-Administrativa para la Facultad, la cual comenzó a regir a partir de Agosto de 2000. En esta nueva estructura aparece lo que es hoy en día la Escuela de Ingeniería de Sistemas y Computación (EISC), destinada a desarrollar, coordinar y dirigir académica y administrativamente los programas académicos de sistemas y computación y a ser una unidad académica que lidere todos los procesos de enseñanza y aprendizaje informáticos en la Universidad del Valle. A esta nueva escuela se le adscriben los programas: Programa Académico de Ingeniería de Sistemas (PAIS), Programa Académico de Tecnología en Sistemas de Información (PATSI) en modalidad presencial y el de Especialización en Sistemas de Información, de acuerdo con la Resolución 054 de Julio 9 de 2010 del Consejo Superior.